Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNB1P62873 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GNB1P62873 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GNB1P62873 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GNB1P62873 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GNB1P62873 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GNB1P62873 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GNB1P62873 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms