Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARF6P62330 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARF6P62330 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARF6P62330 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARF6P62330 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARF6P62330 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARF6P62330 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARF6P62330 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms