Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms