Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME5P56597 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME5P56597 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME5P56597 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME5P56597 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME5P56597 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME5P56597 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms