Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOSBP53539 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOSBP53539 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOSBP53539 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOSBP53539 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOSBP53539 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOSBP53539 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOSBP53539 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOSBP53539 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOSBP53539 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOSBP53539 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOSBP53539 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOSBP53539 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOSBP53539 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOSBP53539 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOSBP53539 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOSBP53539 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms