Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRIP2P52943 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP2P52943 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms