Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RORCP51449 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RORCP51449 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RORCP51449 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RORCP51449 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RORCP51449 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RORCP51449 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RORCP51449 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RORCP51449 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RORCP51449 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RORCP51449 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms