Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP1P50238 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms