Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC34P49427 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC34P49427 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC34P49427 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms