Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD4P46934 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms