Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms