Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJC1P36383 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJC1P36383 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJC1P36383 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJC1P36383 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJC1P36383 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJC1P36383 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJC1P36383 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJC1P36383 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJC1P36383 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms