Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYH11P35749 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH11P35749 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH11P35749 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH11P35749 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH11P35749 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH11P35749 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYH11P35749 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYH11P35749 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYH11P35749 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH11P35749 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH11P35749 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH11P35749 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH11P35749 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH11P35749 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH11P35749 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH11P35749 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH11P35749 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYH11P35749 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYH11P35749 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYH11P35749 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms