Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF4P34130 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF4P34130 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF4P34130 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms