Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP1P28562 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms