Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLD1P28340 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLD1P28340 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLD1P28340 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLD1P28340 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLD1P28340 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLD1P28340 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLD1P28340 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLD1P28340 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms