Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB4P28070 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB4P28070 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB4P28070 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB4P28070 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB4P28070 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB4P28070 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB4P28070 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB4P28070 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB4P28070 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB4P28070 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB4P28070 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB4P28070 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB4P28070 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB4P28070 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB4P28070 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB4P28070 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms