Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB9P28065 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms