Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YY1P25490 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YY1P25490 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YY1P25490 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YY1P25490 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YY1P25490 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YY1P25490 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YY1P25490 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YY1P25490 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YY1P25490 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YY1P25490 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YY1P25490 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YY1P25490 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YY1P25490 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YY1P25490 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YY1P25490 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms