Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASTP20810 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASTP20810 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASTP20810 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASTP20810 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASTP20810 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASTP20810 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASTP20810 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASTP20810 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASTP20810 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASTP20810 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASTP20810 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASTP20810 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASTP20810 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASTP20810 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASTP20810 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASTP20810 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASTP20810 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASTP20810 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASTP20810 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASTP20810 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASTP20810 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASTP20810 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASTP20810 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASTP20810 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASTP20810 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASTP20810 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASTP20810 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASTP20810 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASTP20810 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASTP20810 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms