Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL2P19875 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL2P19875 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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