Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM21P19474 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms