Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCP1P17987 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCP1P17987 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCP1P17987 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCP1P17987 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCP1P17987 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCP1P17987 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms