Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A2P16615 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms