Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD44P16070 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CD44P16070 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD44P16070 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD44P16070 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD44P16070 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD44P16070 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD44P16070 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD44P16070 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms