Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATA1P15976 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA1P15976 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA1P15976 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA1P15976 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA1P15976 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA1P15976 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA1P15976 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA1P15976 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA1P15976 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA1P15976 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA1P15976 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms