Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRAFP15056 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRAFP15056 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRAFP15056 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRAFP15056 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRAFP15056 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRAFP15056 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms