Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCP1P13796 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCP1P13796 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCP1P13796 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCP1P13796 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCP1P13796 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCP1P13796 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCP1P13796 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCP1P13796 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms