Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP4P12644 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP4P12644 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BMP4P12644 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMP4P12644 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMP4P12644 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMP4P12644 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP4P12644 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP4P12644 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP4P12644 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMP4P12644 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMP4P12644 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMP4P12644 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BMP4P12644 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms