Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms