Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3P10147 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL3P10147 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL3P10147 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL3P10147 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL3P10147 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3P10147 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3P10147 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3P10147 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms