Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC192P0DO97 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms