Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SETSIPP0DME0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETSIPP0DME0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms