Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRGAP2CP0DJJ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRGAP2CP0DJJ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms