Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRR29P0C7W0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR29P0C7W0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms