Protein–RNA interactions for Protein: P09914

IFIT1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT1P09914 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT1P09914 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT1P09914 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms