Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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