Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA1P02708 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms