Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGGP02679 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FGGP02679 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGGP02679 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGGP02679 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGGP02679 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGGP02679 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGGP02679 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGGP02679 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGGP02679 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGGP02679 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGGP02679 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGGP02679 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGGP02679 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGGP02679 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGGP02679 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGGP02679 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGGP02679 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGGP02679 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGGP02679 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGGP02679 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGGP02679 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGGP02679 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGGP02679 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGGP02679 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGGP02679 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGGP02679 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms