Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOC1P02654 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOC1P02654 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC1P02654 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms