Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD3O95983 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD3O95983 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD3O95983 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD3O95983 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD3O95983 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD3O95983 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD3O95983 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD3O95983 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MBD3O95983 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MBD3O95983 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MBD3O95983 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD3O95983 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD3O95983 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD3O95983 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD3O95983 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms