Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNAPINO95295 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms