Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBE4BO95155 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE4BO95155 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms