Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM13AO94988 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
FAM13AO94988 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM13AO94988 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms