Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP9O75884 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms