Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMUO75648 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMUO75648 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMUO75648 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms