Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG13O75143 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG13O75143 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG13O75143 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG13O75143 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG13O75143 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG13O75143 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG13O75143 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG13O75143 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms