Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA5O60264 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms