Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNIP3LO60238 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BNIP3LO60238 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BNIP3LO60238 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BNIP3LO60238 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP3LO60238 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP3LO60238 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms