Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDIL3O43854 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms